تحتضن حديقة الحيوانات بالعين مجموعة نادرة وفريدة من بطاريق هومبولت الشهيرة التي تم تصنيفها على أنها معرضة للخطر وفقًا للقائمة الحمراء للأنواع المهددة بالانقراض الصادرة عن الاتحاد الدولي لصون الطبيعة، وبالإضافة إلى 16 نوعًا آخر من طيور البطريق ، تتناقص أعدادها بسبب تهديدات كثيرة مثل الصيد غير المشروع ، وجمع فضلاتها لاستخدامها كسماد طبيعي، والصيد الجائر، وتلوث المحيطات والتغير المناخي.
ويبلغ عدد البطاريق في الحديقة 85 بطريقاً تحظى بأعلى معايير الحماية والحفظ في بيئة طبيعية مماثلة لموطنها في معرض داخلي، وبإشراف ورعاية مجموعة من المدربين والأطباء البيطريين المتخصصين في تربية البطاريق. ومن الجدير ذكره أن حديقة الحيوانات بالعين استطاعات وعلى مدى السنوات السابقة إكثار البطاريق بنجاح من خلال توفير الرعاية المناسبة ومتطلبات التعشيش والتكائر وكذلك استخدام تقنيات الاكثار الحديثة.
كما تقدم الحديقة للجمهور تجارب رائعة مع هذه الحيوانات الظريفة، بالإضافة لتوعية الزوار بالأخطار التي تواجهها في الطبيعة و كيفية الحفاظ عليها و دور المجتمع والمؤسسات في حفظ الحيوانات المهددة بالانقراض وحماية الحياة البرية.
وعلى مستوى المشاريع الجديدة سوف تقدم الحديقة أول معرض خارجي للبطاريق في الشرق الأوسط يتيح للزوار فرصة الدخول إلى منطقة الشاطىء والتفاعل المباشر مع البطاريق وإطعامها ومشاهدتها وهي تسبح في أحواضها الخارجية بمهارة من خلال النوافذ الزجاجية التي صممت خصيصاً لذلك.